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「碼農(nóng)」和大佬的下一站,合成生物學(xué) 2021-11-01 15:23:33  來源:36氪

10 月 15 日,辭退了搜狗 CEO 的王小川表示,往后二十年,「想為生命科學(xué)和醫(yī)學(xué)的發(fā)展盡一份力」。這已經(jīng)是今年第三位在辭職時(shí)對(duì)「生命科學(xué)」表示出興趣的互聯(lián)網(wǎng)大佬。

5 月 20 日,張一鳴在卸任字節(jié)跳動(dòng) CEO 的信中寫道,「生命科學(xué)……對(duì)人類生活的影響已現(xiàn)黎明之曙光」;3 月,黃崢在辭職信中說,「想去做一些食品科學(xué)和生命科學(xué)領(lǐng)域的研究」。

黃崢甚至在辭職信中寫了三個(gè)未來的研究方向:蛋白質(zhì)機(jī)器人、植物合成蛋白「人造肉」、在作物種植過程中控制微量元素吸收。

想解決的問題各不相同,又有某些相通:對(duì)生物自然過程進(jìn)行精微調(diào)控。再細(xì)究下去,這些研究可能都會(huì)涉及到目前最受關(guān)注的生物學(xué)領(lǐng)域「合成生物學(xué)」。

有人說,目前合成生物學(xué)就像 90 年代初的互聯(lián)網(wǎng),剛剛過了嬰兒期,會(huì)出現(xiàn)一大批初創(chuàng)公司,說不定就會(huì)有下一個(gè)蘋果這樣的公司出現(xiàn)。

10 月初,我在上海參加了一場(chǎng)小熊貓生物發(fā)起的「Synbiopunk 2021 暨生物開發(fā)者大會(huì)」,試著理解「生命科學(xué)浪潮」(如果真的在到來的話)究竟可能是什么樣的?

大會(huì)現(xiàn)場(chǎng) | 極客公園攝

01細(xì)胞工場(chǎng)

在會(huì)上,我又聽見人們談起「人造肉」。

沿襲計(jì)算機(jī)會(huì)議模式,自由交流的「unconference 自組織會(huì)議」上,有人邊喝啤酒邊聊:「合成生物學(xué)」有什么成功的產(chǎn)品?有人提到了 Impossible Food 旗下的「人造肉」。

Impossible Food 從沒有自稱「合成生物學(xué)」公司,但是將它與其它人造肉產(chǎn)品區(qū)分開來的核心賣點(diǎn)——那個(gè)讓素肉聞起來有獨(dú)特「肉香」的血紅蛋白,來自這門誕生 20 年左右的新興學(xué)科。

其中涉及的技術(shù),就是用簡(jiǎn)單的基因編輯,讓酵母產(chǎn)生「血紅蛋白」。套用一下合成生物學(xué)的術(shù)語,就是讓酵母菌就變成「細(xì)胞工廠」,按照人的意愿來生產(chǎn)物質(zhì)。

是什么讓肉這么鮮紅,吃起來又有特殊的香氣呢?Impossible Food 認(rèn)為是肉里面豐富的「血紅蛋白」。在各種食物中,都有血紅蛋白,但是動(dòng)物肌肉中含量尤其多。

因此,血紅蛋白就被公司的創(chuàng)始人,生物化學(xué)家帕特里克·布朗(Patrick O. Brown)選擇作為模擬動(dòng)物肉的「關(guān)鍵調(diào)料」。從植物中提取這種「調(diào)料」,布朗選中了根部含有豐富血紅蛋白的大豆。

傳統(tǒng)的生產(chǎn)方式需要從大豆根部直接提取「血紅蛋白」,一公斤的「血紅蛋白」就需要 6 畝大豆。植物提取耗費(fèi)成本,Impossible Food 研發(fā)了新方式:將能編譯血紅蛋白的基因植入酵母菌中,隨著酵母菌生長和復(fù)制,就會(huì)生長出血紅蛋白。打個(gè)比喻,這就仿佛是在微生物的尺度上,讓鵝生下雞蛋。

從植物中提取的 血紅蛋白(Heme)用在「人造肉」?jié)h堡中

新技術(shù)提高生產(chǎn)效率,同時(shí)減少種植消耗的自然資源。由于主要的生產(chǎn)資料是酵母菌、糖、礦物質(zhì),也沒有太多化工廢料。想起來,這真是一種「讓未來更美好」的技術(shù)。

聽人們談起這個(gè)技術(shù)的時(shí)候,我感到這只一個(gè)簡(jiǎn)單的技術(shù)。在他們眼中,可以這樣從基因?qū)用嬖O(shè)計(jì),再生產(chǎn)出來的物質(zhì)實(shí)在太多了??山到馑芰?、香料、新藥和疫苗、針對(duì)特定病害的農(nóng)藥,甚至是用二氧化碳合成淀粉……我開始對(duì)生物技術(shù)帶來的可能有了些具體想象。

02工程思想遇到生物學(xué):生物開發(fā)者

從命名上來說,這是全球第一場(chǎng)「生物開發(fā)者」大會(huì)。「生物開發(fā)者 Biodeveloper」這個(gè)詞是從 IT 領(lǐng)域常見的「開發(fā)者」沿用而來。

會(huì)議發(fā)起者,也是主辦方的「小熊貓生物」解釋說,生物科技行業(yè)的分工越來越細(xì),開始出現(xiàn)了一個(gè)中間層群體,再用以前的生物工程師、研發(fā)科學(xué)家來稱呼似乎不夠涵蓋這個(gè)群體的豐富性。

小熊貓生物對(duì)自己的稱呼是「全球首家生物計(jì)算機(jī)」公司。大會(huì)的另外兩家主辦方分別是創(chuàng)業(yè)公司倍生生物、奇績創(chuàng)壇。倍生生物對(duì)自己的稱呼是「專注于物種設(shè)計(jì)的合成生物學(xué)公司」。

小熊貓生物 CEO 郭昊天解釋「生物開發(fā)者」命名的由來 | 小熊貓生物

IT 行業(yè)有各種各樣的開發(fā)者,比如網(wǎng)頁開發(fā)者、軟件開發(fā)者、游戲開發(fā)者。類似的,生物科技行業(yè)不同的人也會(huì)面對(duì)不同的研究對(duì)象、工作內(nèi)容?!傅撬麄兊墓ぷ餍再|(zhì)很相似,都是基于已有的知識(shí)、已有的工具、方法去開發(fā)新的產(chǎn)品和新技術(shù)」。

他們?cè)谧龅氖虑?,有些現(xiàn)在聽起來還挺陌生。比如發(fā)酵產(chǎn)品的菌株開發(fā)、底盤微生物重構(gòu)、蛋白質(zhì)藥物設(shè)計(jì)、分子育種、類器官改造。

合成生物學(xué)家 Tom knight 說,「21 世紀(jì)會(huì)是工程生物學(xué)的世紀(jì)」。他是合成生物學(xué)領(lǐng)域的創(chuàng)始者之一,也是合成生物學(xué)明星公司 Ginkgo Bioworks 的五位創(chuàng)始人之一。這家公司 9 月 18 日在紐交所上市,估值就達(dá)到了 150 億美元。

Tom Knight 的研究興趣經(jīng)歷了從計(jì)算機(jī)到生物學(xué)的轉(zhuǎn)變。從高中時(shí)代開始,他就利用暑假在 MIT 學(xué)習(xí)計(jì)算機(jī)和編程,之后本科和研究生階段也在 MIT 度過。

Tom Knight

意識(shí)到摩爾定律預(yù)言了人類操作硅原子的極限,他將目光轉(zhuǎn)向了生物。「我們需要一種不同的方式,把原子放在正確的位置……最復(fù)雜的化學(xué)是什么?是生物化學(xué)。我想象可以使用生物分子,比如蛋白質(zhì),它們可以在你需要的范圍內(nèi)自我組裝和結(jié)晶。」

用工程學(xué)定量、定性的思想來設(shè)計(jì)生物原件,成為新的研究方式。合成生物學(xué)像是人類知識(shí)的一次躍遷。作為一門工程學(xué)、計(jì)算機(jī)、生物學(xué)等多學(xué)科的交叉領(lǐng)域,合成生物學(xué)的起始之年被定為 2000 年。

在這一年發(fā)表的兩項(xiàng)研究中,生物學(xué)家用電路設(shè)計(jì)的思路,實(shí)現(xiàn)了對(duì)基因表達(dá)的控制。

波士頓大學(xué)的科學(xué)家在大腸桿菌中構(gòu)建了基因開關(guān) (Gene toggle switch)。這個(gè)模型只用了兩個(gè)基因模塊,通過調(diào)控外界刺激,可以讓基因的表達(dá)開或者關(guān)。

同樣是這一年,普林斯頓大學(xué)的科學(xué)家用了三個(gè)基因模塊,利用它們之間互相的抑制和抑制解除,實(shí)現(xiàn)了電路信號(hào)中的「震蕩」模式輸出。

基因開關(guān)(Gene toggle switch) 示意圖

03對(duì)基因讀、寫、改

DNA 從源頭上攜帶生命的所有信息,也是生命萬千性狀的來源。

發(fā)展到如今,人類已經(jīng)能夠輕松地讀取 DNA 序列,按照設(shè)計(jì)合成 DNA 序列。會(huì)場(chǎng)上,我多次聽到人們談起獲得 2020 年諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)的 CRISPR 技術(shù)。這項(xiàng)被稱作「基因魔剪」的技術(shù),可以精準(zhǔn)定位切割 DNA,從而實(shí)現(xiàn)基因編輯。

基于這項(xiàng)基因編輯技術(shù),已經(jīng)出現(xiàn)了多家創(chuàng)業(yè)公司。有的用它來解決癌癥、遺傳病等疑難疾病的基因治療,有的用它培育可供人類移植的器官、檢測(cè)疾病。

一項(xiàng)基因編輯技術(shù)如此快進(jìn)入商業(yè)應(yīng)用,讓人們看見生物技術(shù)的巨大前景。從生物技術(shù)自身的發(fā)展邏輯而言,在基因序列的讀取、合成、編輯都發(fā)展成熟之后,下一個(gè)階段,自然是從基因?qū)用孢M(jìn)行設(shè)計(jì),來生產(chǎn)符合人類需求的物質(zhì)。合成生物學(xué)技術(shù),也可以理解為基因技術(shù)發(fā)展的下一個(gè)階段。

「很多人一直癡迷于合成生物學(xué)的定義……工程學(xué)科和生物學(xué)科之間發(fā)生了這種碰撞。我認(rèn)為,由此產(chǎn)生的任何東西已經(jīng)開始被命名為合成生物學(xué)?!筎om Knight 說。

將時(shí)間尺度拉大,遠(yuǎn)從農(nóng)業(yè)社會(huì)開始,人類就通過漫長的雜交和選種來篩選、保留自己想要的動(dòng)植物性狀。合成生物學(xué)則是從基因?qū)用嬷苯尤胧?,生成人類想要的性狀。眼下,科學(xué)家已經(jīng)在實(shí)驗(yàn)室里用 CRISPR 技術(shù)培育水稻。

大會(huì)的主辦方之一,奇績創(chuàng)壇創(chuàng)始人陸奇在開場(chǎng)視頻中說,生物技術(shù)可能會(huì)像之前的互聯(lián)網(wǎng)技術(shù)一樣,對(duì)世界帶來廣泛的變革。這似乎也印證了互聯(lián)網(wǎng) CEO 辭退時(shí)都表達(dá)出對(duì)生命科學(xué)的興趣。

互聯(lián)網(wǎng)大佬們都紛紛投來關(guān)注的目光,生命科學(xué)的商業(yè)大勢(shì)終于要來了嗎?

湊巧的是,在「生物開發(fā)者」大會(huì)開始的前幾天,上市不久的 Ginkgo 遭遇了做空機(jī)構(gòu)的質(zhì)疑。在大會(huì)期間,公司的股票價(jià)位正經(jīng)歷上市以來最低位。(雖然現(xiàn)在已經(jīng)恢復(fù))這讓「商業(yè)模式」這個(gè)話題更吸引人。

04商業(yè)故事剛剛開始:平臺(tái)和選品

和互聯(lián)網(wǎng)時(shí)代的巨頭一樣,Ginkgo 是一家說「平臺(tái)故事」的公司。

將自己定義為「細(xì)胞編程技術(shù)供應(yīng)商」,Ginkgo 說的是一個(gè)「細(xì)胞編程」重塑生產(chǎn)方式的故事:用編程過的細(xì)胞作原料,制造食物、材料、新藥、香料……

公司 CEO 表示,Ginkgo 是一個(gè)技術(shù)平臺(tái),它不生產(chǎn)產(chǎn)品,而是在其它公司研發(fā)產(chǎn)品階段提供服務(wù)而收費(fèi)、或是大規(guī)模生產(chǎn)后獲得抽成。

如果生物生產(chǎn)的方式將帶來廣泛變革,技術(shù)平臺(tái)一定會(huì)成為行業(yè)中的巨頭。Ginkgo 剛剛上市時(shí),來自紐約 Pinnacle Associates 的投資經(jīng)理 Randy Baron 評(píng)論道:「這要么是有史以來最大的空頭,要么是下一個(gè) AWS」。

Tom Knight(左一) 和其它四位 Ginkgo Bioworks 創(chuàng)始人 | Ginkgo Bioworks

既然技術(shù)前景樂觀,孵化出了什么產(chǎn)品?這是 Ginkgo 面臨的一大質(zhì)疑。還沒出現(xiàn)強(qiáng)營收能力的產(chǎn)品,平臺(tái)估值就水漲船高。用互聯(lián)網(wǎng)的發(fā)展來打比方,這就類似于還沒有出現(xiàn)「殺手級(jí)應(yīng)用」,大家已經(jīng)在想象未來的行業(yè)巨頭。

聽會(huì)上的討論,人們反復(fù)提到「選品」??雌饋?,大家已經(jīng)達(dá)成共識(shí),「選品」是目前合成生物學(xué)創(chuàng)業(yè)公司至關(guān)重要的能力。

前不久,Impossible Food 傳出了 IPO 消息。憑借「血紅蛋白」這項(xiàng)標(biāo)志技術(shù)打下一片市場(chǎng),這是 Imposeeible Food 提供的成功產(chǎn)品經(jīng)驗(yàn)。

但換一個(gè)市場(chǎng)就未必可行,畢竟在中國「植物肉」只是小部分消費(fèi)者的需求。

人們談?wù)摳嗟?,還是合成生物學(xué)公司在選品上走過的彎路。

合成生物學(xué)領(lǐng)域的第一家上市公司 Amyris 此前靠產(chǎn)生青蒿酸(artemisinic acid)的酵母菌株被資本看好。青蒿酸是生產(chǎn)青蒿素的前體。青蒿素就是在 2015 年,讓中國科家屠呦呦獲得諾獎(jiǎng)的抗瘧疾藥。

實(shí)現(xiàn)青蒿素量產(chǎn),讓 Amyris 成功上市,但卻沒有讓它賺錢。最初,合成生物法產(chǎn)青蒿素的確解決了化工合成成本過高的問題。但是隨著非洲大面積種植黃花蒿成功,植物提取成本下降,合成生物量產(chǎn)優(yōu)勢(shì)又不復(fù)存在。

實(shí)現(xiàn)生物合成青蒿素的科學(xué)家 Jay Keasling ,后來他寄希望的生物燃料商業(yè)上也沒有成功

青蒿素之后,Amyris 又把目光轉(zhuǎn)生物燃料。看起來很美好:生物材料取代化石材料,是能源危機(jī)的出路。只是化石燃料的低生產(chǎn)成本面前,生物合成法沒能建立優(yōu)勢(shì)?,F(xiàn)在,Amyris 又選擇了護(hù)膚品,用生物燃料的原材料「法尼烯」來生產(chǎn)維生素 E、角鯊?fù)椤?/p>

在生產(chǎn)可降解塑料 PHA 上摸索了五年之后,藍(lán)晶微生物在今年 2 月份獲得了 2 億元 B 輪融資。這也成為國內(nèi)合成生物學(xué)單筆最大融資。藍(lán)晶接下來將建設(shè) PHA 年產(chǎn)萬噸級(jí)工廠。

合成生物學(xué)目前的考題似乎是:要向市場(chǎng)說明產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)。

05未來:生物技術(shù)的產(chǎn)品多久會(huì)到來?

我問一位參會(huì)的從業(yè)人員,現(xiàn)在合成生物學(xué)發(fā)展到什么階段了? 他說,很像 90 年代初的互聯(lián)網(wǎng),剛剛起步,又充滿想象。但是也會(huì)有所不同,中國和美國的差距沒有當(dāng)時(shí)那么大,在發(fā)展的過程中,生物技術(shù)和傳統(tǒng)行業(yè)的聯(lián)系也會(huì)更緊密。

在會(huì)上,我遇到對(duì)新生產(chǎn)方式贊嘆不已的人,是一位香料公司的經(jīng)理。他來自馨之源科技,主要的產(chǎn)品是龍涎香的原料「降龍涎香醚」。

龍涎香是高級(jí)香水的「定香劑」。自然界中的龍涎香源于抹香鯨的腸胃分泌物,非常珍貴,號(hào)稱香料之王,主要的作用就是定香。

甚至可以說,有了龍涎香,才有了現(xiàn)在常見的「品牌香水」。它讓香氛穩(wěn)定,留香時(shí)間能從 40 分鐘延長到 4 小時(shí)。除了高檔香水,它更常見的使用是被添加在洗發(fā)水、沐浴液,洗衣液等日化產(chǎn)品里,少量用于食用香精。

自然界最接近龍涎香的產(chǎn)品源于 1930 年代德國漢高公司。以香紫蘇花做原料,先進(jìn)行植物提取,再經(jīng)過多道化學(xué)反應(yīng),經(jīng)歷香紫蘇醇、到香紫蘇內(nèi)酯的過程,最后生成降龍涎香。

從 2016 年開始,他的公司能夠用生物合成的方法,將香紫蘇醇轉(zhuǎn)化為香紫蘇內(nèi)酯。分子轉(zhuǎn)化率和純度能達(dá)到 99.8%。「作為一家細(xì)分領(lǐng)域的小型冠軍企業(yè),我們體會(huì)到合成生物學(xué)的意義非常大」,他說。

和化學(xué)合成相比,生物合成不僅轉(zhuǎn)化率和純度明顯提高,還避免了會(huì)帶來污染的高錳酸鉀廢水。接下來,他希望能夠技術(shù)上再突破,從「糖」直接生物合成更多的香料產(chǎn)品。這樣就可以跳過植物提取,節(jié)省土地成本、生產(chǎn)也更低碳。

午餐席間,我聽到一條新聞:聯(lián)合利華 9 月 2 日表示,它將投資 10 億歐元,用于在 2030 年前淘汰清潔產(chǎn)品原材料中的化石燃料。

在 10 年內(nèi),保潔生產(chǎn)的洗衣液、洗衣粉、香皂類產(chǎn)品都會(huì)逐漸采用植物原料、或者碳捕捉技術(shù)。公司還拿出另 10 億歐元設(shè)立基金,資助研究生物技術(shù)、二氧化碳等減少碳排放的技術(shù)。

告訴我這個(gè)新聞的人,和聽到新聞的我一樣,對(duì)不到 10 年的期限有些訝異:技術(shù)研發(fā)到大規(guī)模生產(chǎn),這么快就會(huì)完全實(shí)現(xiàn)嗎?

不過我希望真的會(huì)實(shí)現(xiàn)。

公眾號(hào)“極客公園”(ID:geekpark),作者:凌晨,36氪經(jīng)授權(quán)發(fā)布。

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